攻入省城桂林，使韦银豹的声望达到了顶点，也是他愈发轻视起大明来，竟然于嘉靖四十五年继续北上，杀入湖南省境，终于引起了朝廷的严重关注。于是，时任兵部尚书杨博，命俞大猷为广西总兵官，李延为广西巡抚，调集重兵平叛。俞大猷这位沙场宿将，虽然在某些人的打压下，一直郁郁不得志，但他从未丧失军事敏感，随时都做好了战争准备，一接到命令，便从广东入境，直捣韦银豹的老巢古田。
与戚家军齐名的俞家军，不是寻常官军可比，一路上势如破竹，顺利收复桂林城，兵锋直逼韦银豹的老巢古田。韦银豹大为震动，从湖南撤军回援，与俞大猷多次交战，均处于下风，只能利用地利与对方周旋。俞大猷也不着急，稳扎稳打，攻心为上，已经将韦银豹的势力压缩在桂林以南，但因为地形复杂，兵力不足，且与巡抚李延理念不同，很难再进一步。
在北进受阻的情况下，韦银豹向南发展，杀害田州土司岑大猛，吞并了广西南部大片土地，收降了两万狼兵，实力大增。官军这边，巡抚李延与总兵俞大猷的分歧越来越大，到了必须留一个、去一个的地步。而李延是高拱的门生，俞大猷却没有靠山，于是和高拱穿一条裤子的杨博，将俞大猷调回广东，另派总兵官听从李延的调遣。
李延大权在握，终于可以按照自己的法子剿匪了，可是五万官军剿了三年，花了朝廷几百万两银子，自己损兵折将，却没伤着韦银豹一根毫毛。而韦银豹在长期与朝廷的对峙中，也渐渐感到独木难支……虽然吞并了岑家的地盘，但他为了救急，在田州横征暴敛，使境内的抵抗此起彼伏。而且岑大寿的弟弟尚在，使他不敢完全信任狼兵。
为了能长久的抵御明军，他竟然求助安南的莫氏王朝，请其出兵帮自己抵抗明军，事成之后，愿与其分治广西南北。狂妄的越南人竟真的答应下来，并出兵三万，帮他抵御明军。其实韦银豹并不是真想把广南拱手相让，他也求助于当时中南半岛最强大的缅甸东吁王朝，同样以广南为条件，请其出兵相助，但被缅甸王莽应龙识破了他的‘一女两许’之计，所以没有出兵。
但就算这样，韦银豹也东拼西凑，拉起了十万大军……这时候，如果他继续坚守，神仙也拿他没办法。可他的部队不是原先的三万，而是十万大军。这十万人人吃马嚼，就算他占了半个广西也养不起，所以只能主动向富庶的广西北部发起攻击。而他的对手李延，这几年吃空饷吃得肥肠满脑，刮地皮刮得天怒人怨，一见韦银豹大军前来，各部土司纷纷倒戈。李延未战先怯，竟还没看到韦银豹，就先退出了一百里，桂林又一次失守。之后明军节节败退，一直被赶到了湖南，广西全境失陷，朝野震怒。
朝中上下意识到，如果再不正视韦银豹叛乱，大明就将失去越南一样，永远失去广西了。连素来不过问国事的隆庆帝，也破例召开朝会，讨论平叛之策。大臣们都被号称三十万的叛军吓住，一直认为这时候，唯有一人可以去收拾残局，那就是少傅、太子太保、武英殿大学士、内阁次辅沈默。
加之这时候，河套作战任务基本结束，可预期的数年内，不会有大的战争，隆庆便同意了这一建议，下旨加沈默为太保，命其督师平叛，天下各省兵马粮草任其调遣。
沈太保一到了湖南，便斩了李延的脑袋，传首南方六省，彰明自己对贪酷怯懦者的态度。然后调江西布政使殷正茂为广西巡抚，命两广总督吴百朋率广东总兵俞大猷进桂听命。
遣将之外，更是调集重兵，他从湖南调来了永顺、保靖土兵四万多人；从南直、浙江、福建调来了火枪兵三万人；加上广西原先四万土兵，以及吴百朋从广东带来的三万兵马，共十四万余兵力，并故技重施，发行战争债券，筹集到四百万多两白银以备军饷……只是不知道，这次他拿什么为标的物。
这么多军队，不同族不同省，还有新败之军，要是换一人统帅，不用打自己就乱套了。但人的名树的影，如今的沈默，身居东南抗倭、赣南剿匪、收复河套的累累战功，早就成为大明军神一般的人物……虽然他从未指挥过任何一场战争。他一到广西，濒临溃散的军心便很快稳定住，甭管是哪一族哪一省的，没一个敢触他的霉头。那些官吏将领也不敢再偷奸耍滑、贪赃枉法，全都老老实实听从调遣。
沈默永远不会去干自己不擅长的事情，他把这些杂牌军队扔给了殷正茂和俞大猷，让这两人操练整顿，迅速捏出战斗力。他自己则与吴百朋一道，施展计谋，软硬兼施，分化瓦解韦银豹的联军，但凡归顺朝廷的土司，都既往不咎，厚加赏赐。因为很多土司与朝廷无冤无仇，甚至是世受皇恩，只是被韦银豹裹挟，才不得不出兵，看到朝廷要动真格的了，都吓得寝食不安。
现在沈默赦免了他们的罪过，还有赏赐，土司们自然动起了归心，几乎每天都有趁夜色率众投降的。面对不利局面，韦银豹知道不能贪多求全，于是在将桂林洗劫一空后，主动收兵，退回古田根据地。
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